Jest to opis pierwszych kilku godzin gry będących wstępem do kilkudziesięciogodzinnej historii pełnej nieprzewidywalnych zwrotów akcji. Fabuła razem z postaciami to według mnie najmocniejsza strona tej kultowej gry.
Grę rozpoczynamy w wysoko rozwiniętym technologicznie mieście Midgar. Miasto czerpie energię z reaktorów mako pochłaniając w ten sposób naturalną siłe ziemi politycznie i militarnie zdominowanej przez korporację Shin-ra, podczas udanego zamachu bombowego organizacji Avalanche na jeden z reaktorów Mako w Midgar. Po udanej akcji dochodzi do kłótni między nowo poznanymi bohaterami – Cloudem i Barretem – o zapłatę. Spór łagodzi przyjaciółka Clouda, Tifa. Podczas zamachu na następny reaktor stanęli do nierównej walki z robotem prezydenta Shinry który po kilku minutach walki eksploduje zrzucając Clouda z pomostu, Cloud odłącza się od grupy i w opuszczonym kościele spotyka kwiaciarkę Aeris.
Wyruszają z powrotem do slumsów Sektora 7, gdzie znajduje się baza Avalanche,w drodze Cloud napotyka powóz gdzie spostrzegł Tifę która została uprowadzona do siedziby lokalnego przywódcy, Don Corneo. Dzięki pomocy Aeris,przebrany za kobietę Cloud dostaje się wraz z Aeris do rezydencji Dona i ratują Tifę. Po mozolnej ucieczce przez cmentarzysko pociągów wreszcie trafiają z powrotem do Sektora 7, okazuje się że żołnierze Shinry wraz z członkami organizacji Turks zamierzają wysadzić w powietrze filar podtrzymujący pokrywę całego sektora, w ten sposób zabijając wszystkich członków organizacji Avalanche. Na domiar złego Turksowie porywają Aeris, która jest ostatnią przedstawicielką rasy Starożytnych i może się z tego powodu okazać bardzo przydatna.
Mimo rozpaczliwej walki bohaterów filar zostaje wysadzony, giną wszyscy mieszkańcy sektora, poza Cloudem, Barettem i Tifą, którym w ostatniej chwili udaje się uciec. Dzięki Aeris ocalona została także córeczka Baretta, Marlene. Po opanowaniu rozpaczy spowodowanej stratą przyjaciół, bohaterowie decydują się na wejście do wieżowca Shinry i odbicie Aeris.